制造疫苗最大的障碍是艾滋病病毒能不断突变，由于变异太快，所以等一种候选疫苗研究出来后已经不能识别艾滋病病毒的真面目并与之对抗了！

现在较好的方法是2～3种抗艾滋病病毒药物联合使用（称鸡尾酒式疗法）。遗憾的是目前的药物只能减轻病人的症状，延长生命而已，最终并不能把体内的艾滋病病毒全部消灭。况且艾滋病病毒能对这些药物产生耐药性、对病人的副作用也很大，同时价格又极为昂贵。